目前，中國制造企業在進行MES建設時存在兩種模式：一種是選擇成熟產品的咨詢實施模式，一種是自主建設模式。大多數企業選擇的是第一種模式，但是一方面由于中國制造企業管理文化上的特色以及某種落后性，使得MES顯得在中國制造企業水土不服，很多功能模塊無法在企業內部進行推廣；另一方面，市場上一些MES產品在技術和管理思想上的不成熟或缺乏實施經驗，導致企業對MES產品的滿意度比較低。因此，一部分具有很強研發和資金實力的企業選擇了自主開發的模式。
兩者比較起來，自主開發實施周期長，系統維護復雜，但應用見效快；選擇成熟產品，實施周期短，系統維護工作量小，但應用見效慢。但是，選擇自主開發的企業大多具有一定的實施背景條件，如承擔某項大型的科研示范工程，或者在國際合作中引入了某原型軟件并進行消化吸收。對于國內大多數企業來說，選擇成熟產品進行適當二次開發是一種更為明智的做法。
