質量管理作為MES系統一個非常重要的功能，通過SPC、SQC分析質量問題的源頭，在根源處消除隱患。全面的質量管理從原材料的檢驗、加工過程控制、質量檢驗與改進到產品質量總結，都能實現質量數據與信息的實時展現與共享。生產管理人員可以查閱實時的質量數據，及時查找和分析結果背后的原因，第一時間給出解決對策。
MES質量管理采用計算機自動編碼和條碼提取并檢驗相關的質檢信息，制定相應的質量管理流程，實現原材料供應商的評估和選擇，并對采購的原輔材料進行抽樣檢驗，嚴格控制采購品的質量。這樣既保證了IQC過程的安全、可靠性，提升產品制造過程中的良品率。
MES系統的質量管理功能包括：質量標準管理、過程質量控制、檢測數據采集、質量統計分析、質量指標考核等功能。
MES質量的過程管理模塊作為MES系統的核心功能，由統計分析過程(SPC)負責生產過程的一切管理。而SPC由statistical(統計)、process(過程)、control(控制)構成，其中statistical(統計)以數理統計為基礎，基于數據的科學分析和管理方法，識別企業生產過程中的變差，從而消除特殊原因引起的各種問題。process(過程)負責生產的輸入和輸出活動。control(控制)通過掌握規律來預測未來的發展并實現預防。
MES質量檢驗可以通過多種手段取得實際的數據，而質量檢驗的結果要依據產品技術標準和相關的文件或檢驗規程的規定進行對比，確定每項產品質量的特性是否合格，從而對單件或者整個批次的質量進行判定。質量的改進則是通過對質量檢驗提供的數據進行匯總、分析、制定措施，從根本上解決已出現或將要出現的問題, 使產品從設計、制造、服務到滿足顧客要求, 達到一個新水平。
產品質量總結，質量統計報表是生產過程中不可或缺的一種質量管理的統計方式，根據MES系統中存儲的生產流程中的質量信息數據，利用參數統計、概率分布、和數據挖掘等多種統計手段進行質量分析，挖掘產品質量與各種參數之間的規律，并以各種圖形表現出來。提供生產過程中原材料、半成品、報廢品進行月報、季報、年報。
全面的質量管理作為MES系統中的重要模塊，既要完成生產過程的跟蹤，也要負責和ERP進行對接，實現生產過程中的數據共享。
效率科技MES質量管理模塊，實現了制造業務和質量管控過程的自然融合，確保了質量活動與制造過程的完美交互，系統中的質量管控、質量分析等模塊對自動采集得到的海量數據進行篩選、分析與反饋控制，形成數字化為特征的企業車間質量管理體系，能夠有效提高質量管理活動的執行效率，并使制造過程的質量反應能力和質量控制能力得到極大的提高。
