縱觀全國，企業MES管理系統的應用現狀并不樂觀，總體成功率仍是個位數。各個企業面臨的困難各不相同，但主要的問題幾乎一致，包括：將MES管理系統當作杯子碗碟等傳統物質商品；財務、生產物流等模塊分割，數據分離;沒有達成降低庫存、成本、提升效益等真正MES管理系統的應用效益指標。究其原因到底是什么?
除去那些有失偏頗的觀點，影響國內MES管理系統成敗的因素主要是下列3點：
一、僅僅把MES當作一種工具
為使用MES管理系統而使用MES管理系統，沒有在MES應用之前調整理順業務流程，構建規范化的管理體系。
建議：治標治本。在MES管理系統應用之前調整理順業務流程，構建規范化的管理體系。MES與傳統商品區別就在于：它是一種管理思想方法與流程，因此，是否將MES當作管理看待、是否在MES應用之前理順業務流程，構建規范化的管理體系成為MES應用成功與否的第一個前提。
二、選型失敗
選擇了一個流程不通、功能不全或者不實用于本企業的MES管理系統。
建議：應當選擇真正功能強大且適合自己的MES管理系統。MES管理系統與傳統商品的第二區別在于：無法從其外表是判斷出其優劣好壞。很多企業不了解如何選擇一個適合自己的MES管理系統，如果買了一個錯誤且功能低下的MES管理系統，那就無可挽回了，即使是再優秀的實施顧問也不可能修改系統本身的問題。
三、MES管理系統供應商的服務不到位
供應商們也不都是專業人士，他們會選擇派遣程序員來實施服務，而不是企業管理人員。這些程序員往往沒有管理經驗、不懂財務也不懂企管，所提供的服務無法契合業務流程。
建議：MES管理系統的成功3分靠產品，7分靠實施。MES管理系統與傳統商品的第三區別在于：MES管理系統非常注重實施，實施決定成敗及應用效果。因此MES系統供應商應當選擇那些既懂財務、成本，又懂企業管理的顧問師來提供到位的項目制實施方案。
