缺乏管理承諾，不良的項目計劃，不足的項目資源和無效的用戶培訓是導致制造軟件系統無法實現計劃收益的主要因素。就制造執行系統(MES)而言，與這些特定解決方案相關的特定原因通常會成為導致回報減少和實施不成功的主要因素。
項目范圍太廣或不清楚 -MES制造軟件計劃經常試圖提供對生產環境中發生的每個活動的可見性。結果，資源可能浪費在低優先級的活動上，或者浪費在開發幾乎沒有價值或毫無價值的制造執行系統流程中，同時又增加了項目的時間，成本和風險。
MES軟件解決方案與業務環境之間的不合適性 —為支持MES計劃而選擇的業務軟件與公司所使用的特定業務流程之間的脫節會極大地妨礙實施的便利性并大程度地降低收益。缺乏協同作用會導致持續進行昂貴的定制以滿足現有或不斷變化的業務條件或流程，從而降低了系統適應業務需求的敏捷性。如果公司現有的IT環境無法輕松支持所選MES制造軟件解決方案所需的基礎結構，則可能會導致另一個斷開連接。這可能會降低與其他系統的系統集成能力，并且/或者為更復雜的集成或基礎架構升級帶來額外的成本。
缺乏經驗的集成資源 -分配給MES制造執行系統實施的內部資源通常缺乏正確支持該計劃所需的技術技能和經驗。同樣，所選MES解決方案提供商的專業知識可能會受到特定流程和客戶行業需求的限制。這些經驗上的差距可能導致工作被誤導，從而導致項目延遲和系統有效性降低。
實施方法論 –認識到許多MES制造系統解決方案的全面性，組織常常試圖一次實現業務系統的太多功能，因為他們認為沒有所有要素就位，因此系統的價值會降低。這些“大爆炸”或瀑布式實施方法可以大大延長初始項目的完成時間，并且由于無法有效響應可能影響運營的系統或流程故障，可能使組織遭受重大生產中斷的風險。
為了優化實施MES生產執行系統的好處，組織應該認識到以下關鍵成功因素：
1.生產過程的前期分析–對所有現有生產過程的詳細審查，結合關鍵人員的意見，為突出需要關注的過程奠定了基礎，這些過程是制造軟件過程改進活動的合適人選。此分析的輸出使管理層可以根據要獲得的收益來確定要解決的領域的優先級，開始在整個過程中吸引更多的人員，闡明數據的利用和與其他業務信息系統的集成，并為正在進行的分析和部署提供框架。
2.MES制造軟件的成敗取決于在項目的前期發現和定義階段投入的時間和精力。定義工廠正常(更重要的是，異常工作流程)期間發生的所有特定業務步驟和單個過程的過程需要大量的工作。花時間正確執行此重要任務將產生廣泛的好處。
3.與MES制造軟件專家的合作伙伴–在選擇軟件解決方案之前和整個項目中，聘請經驗豐富的MES制造軟件集成商至關重要。獨立的，經驗豐富的，具有豐富業務，行業和技術知識的MES制造系統集成商可以通過以下方式為制造執行系統項目提供關鍵支持：i)協助進行前期生產過程分析/文檔編制，并為MES建議適當的集成機會，ii)協助執行客觀的系統選擇過程，利用從全面過程審查中獲得的知識和制造解決方案的專業知識，iii)協助IT部門評估MES解決方案并闡明可能影響集成，定制和系統性能的基礎設施和技術問題，
4.采用分階段的實施方法–通過構建將MES制造軟件的試點集成與已定義的后續部署目標結合在一起的項目計劃，組織可以快速評估其實施方法的有效性并在整個過程中進行更改。這種方法允許對方法進行早期調整，以確保該方法在后續階段中具有可重復性，并減少了隨著實施過程的進行而導致重大業務中斷的風險。
5.實施有效的溝通計劃–由高級管理層牽頭的全面溝通計劃將繼續強調項目的特定目標及其進度，這是整個項目計劃的關鍵組成部分。它有助于突出業務優先級，使員工參與流程，為實施的每個階段準備操作以及強調MES作為連續的流程改進工具的概念。
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