近幾年，很多企業加大了對企業信息化建設的投入力度，紛紛引入MES制造執行系統。往往有許多企業在MES系統應用上線之后，就自認為快要成功了，工作都松懈了下來，從而導致系統上線之后運行不通暢，甚至失敗。
其實對于MES來說，真正的價值發揮還在于上線之后的應用上。MES系統的上線僅僅代表著MES的建設階段結束，針對于MES上線之后還會面臨各種各樣的問題，需要企業加以重視。其所要面臨的問題主要如下：
1.新流程的執行問題。在實施階段設計得很好的流程在實際使用過程中是否能夠得到很好的執行，事關MES的應用能否達到實施之前的預期目標。因此，新流程能否得到很好的執行是上線后面臨的一個關鍵問題。
2.系統調整的問題。實施MES后，計劃模式及業務流程進行了調整，這個時候系統中設定的某些參數和基礎數據不一定很準確(比如說，計劃期間、安全庫存量、批量等)，上線之后，隨著系統的使用，這些參數的問題會暴露出來，實施階段，這些參數和基礎數據的設定是顧問協助完成的。系統運維階段，如何對這些參數進行調整使其符合企業的實際是一個非常重要的問題。
3.數據的準確性問題。實施MES后，數據的來源基本上就唯一了，數據源頭的錯誤會導致后續一連串的數據錯誤。因此，控制數據源頭的準確性非常關鍵。要保證數據的準確性，不光要求錄入人員有高度的責任心，同時要求錄入人員對其所錄入數據的意義有充分正確的理解。很多企業認為數據錄入是一個簡單的重復性勞動，對此不夠重視，結果導致下游業務部門發現問題的時候才進行處理，結果是費力費時。
4.隊伍的問題。隨著系統的上線，顧問的撤出，這時候企業需要自己的團隊面對所有可能出現的問題。這個時候，企業自己的團隊是否已經準備好了是系統能否正常運行的關鍵。其次，隨著項目的上線，內部團隊的很多人員會覺得系統的運維沒有太大的挑戰和發展，紛紛跳槽。這個時候，企業能否有一個合格的后備梯隊頂上來關系到隊伍的完整性。
5.資金的問題。很多企業的高層覺得，MES上線了，項目完成了，該花的錢已經花了，后面不會再發生費用了。其實不然，MES的后續維護成本絕對不是可以忽略不計的。人員的培訓、系統的維護與優化、硬件的維護等等，這些加起來是一筆不小的費用。
通過以上問題的一一列舉，可以看出，企業MES系統上線之后并不是成功的結尾，而僅僅是另一個開始，需要面臨并且解決的問題還有很多，MES系統的實施價值多會體現在上線之后，所以企業不能夠有任何的松懈，要針對以上問題采取相應措施，來推動企業MES管理系統的實施成功。
