云MES相對于傳統的MES來說，區別在于：
傳統的MES是一個相對封閉的制造執行管理系統，它只是適用于工廠內部使用；而且，很多時候，同一個企業的MES是分離的。如：集團多工廠，上MES只是在車間生產線上，上一套生產數據采集軟件；倉儲的WMS系統，跟線邊庫的管理，以及設備的PLC，都完全隔離的；所以，看似上了MES系統，還有很多其他的系統，其整個工廠都是由一個個信息孤島組成，這樣子整體的效率低，且相互間的配合非常有限。
云MES，是近兩年才興起的，那有些廠商只是將B/S架構的MES系統就稱之為云MES，迷惑用戶，其實這種做法是不可取的。我理解的云MES，應該是一整套完整的工廠信息解決方案，將企業從CRM、ERP等，到中間的WMS、MES系統有機整合在一起；而后會通過互聯網技術，建立起一條從終端用戶、到經銷商、到工廠管理人員、到車間、到倉儲物料的完整信息流。即意味著，工廠的每個人都能快速準確的查詢到，自己需要負責的訂單、完成進度情況；終端用戶，從下單開始，就能掌握整個訂單的流轉情況，中間是否出現異常，以及何時才能拿到產品等。
傳統意義上，一套完整的MES系統需要企業自身做很多功課，投入很多的資源和成本，并需要有后期的維護團隊，大中企業可能才會有這樣的條件，所以，云MES更多的應該是解決中小企業上MES問題(當然，大中企業肯定有這個能力了)。
云MES的主要優勢在于除了具備傳統MES的功能屬性外，在企業多工廠/多生產車間下無需部署多個系統，集成性比較高；云MES一般都是平臺化，模塊化，可支持快速響應開發，所以不需要投入過多開發、維護時間與成本；企業只要有互聯網就可隨時隨地訪問MES系統，大大減少了企業的使用和硬件成本。
但是從目前的實際情況來看，基于云的MES系統使用還存在一定的阻礙。企業發展方式永恒不變的是變化，云MES可以說是一種嘗試，就如同制造業跟風大數據。但大數據究竟為公司帶來了多少實際價值，從制造業角度來說并沒有準確答案，且目前并沒有非常多的實例證明它優于傳統MES，云MES適用的企業類型也比傳統窄。
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