質量管理是MES中的一個核心模塊，質量管理在MES中的運用，使得企業的產品質量管理提升到一個新的階段。
在傳統制造模式和質量理念的驅使和約束下，我國企業的質量管理通常僅限于質量管理部門的獨立活動，質量保證體系條塊分割，各部門、各環節的質量管理活動相對封閉和分散，單純以滿足產品設計規范為目標，注重質量問題的事后處理，難以實現對產品制造過程整體質量水平的控制。傳統的質量保證技術與手段已難以適應現代質量保證的要求，采用MES與質量管理相結合的手段，可以優化傳統質量管理所存在的問題，具體可以實現以下幾個方面的優化:
1)質量信息處理及時化。
傳統的產品質量數據的采集與統計多采用手工方式，效率低下，一致性差，可信度低。而現代制造企業多是進行規格多樣化、個性化、技術尖端化和結構復雜化為主要特征的產品，MES為制造車間提過了小批量制造環境的統計過程技術,可以實現質量信息及時準確采集與處理，針對產品進行事前預防，降低質量事故所造成的大量人力物力財力的浪費。
(2)質量信息流動暢通化。
傳統的質量信息處理過程相對孤立，數據分散、缺乏規范化，MES中的質量管理可以實現數據快速流動，信息通道暢通，可以提高質檢部門與計劃調度部門的及時反饋和工藝部門的及時交流,車間對質量信息的綜合處理能力得到提升，同時可以對產品質量全過程進行有效控制及持續性改進。
(3)提供有效的支持系統與工具。
MES系統為質量業務流程提供保障。軟件系統輔助的質量管理和流程固化的過程控制將制造質量信息同人的操作緊密聯系起來，使物料進入車間加工后，可以對車間的加工質量狀況進行信息追蹤，并為企業計劃層的質量決策提供可靠的依據，從而可以提高車間質量管理效率，有效的控制產品的不合格率。
目前我國國內制造企業的科學管理基礎薄弱、資金缺乏、缺少必要的員工培訓等以外，從企業信息化角度來看，主要障礙之一就是缺乏一種質量數據的組織形式和載體來有效組織和管理產品的相關質量信息，以便盡可能地利用統計分析工具和方法，來實現質量不斷改善的目的。MES中質量管理模塊的優勢就在于運用各種統計工具(例如 SPC(Statistical Process Control),QFD( Quality FunctionDeployment)、控制圖等)大大地挖掘歷史質量數據中所包含的有用的可供決策的質量信息，進而識別具體的產品及過程改進機會，質量數字化管理的成功實施有賴于高質量的數據組織、管理、處理和存儲。
